На территории Киргизии фонд реализует проекты, которые ставят целью адаптировать экономику государства к его вступлению в Единое экономическое пространство и Таможенный союз, это находится в согласии со стратегическими интересами Российской Федерации.

Правительство РФ одобрило для внесения в Государственную думу проект федерального закона о ратификации соглашения с правительством Киргизской Республики о Российско-Кыргызском фонде развития.

Возможность уплаты взносов предусматривается как в долларах США, так и в российских рублях. В состав совета Фонда от Российской Федерации также входят первый заместитель министра экономического развития Алексей Лихачёв и директор департамента финансирования экспорта Внешэкономбанка Даниил Алгульян. Механизм принятия решений на уровне совета фонда и правления фонда обеспечивает учёт российских интересов при принятии решений в рамках деятельности фонда. Совместные проекты направлены на ускоренную адаптацию и интеграцию киргизской экономики в Таможенный союз.